高通量測序服務(wù)-宏基因組測序和宏轉(zhuǎn)錄組測序

    世和基因--高通量測序服務(wù)專家

    2016年，世和基因引進(jìn)HiSeq X “超級” 測序平臺，致力于成為全球領(lǐng)先的基因組學(xué)研究解決方案提供者，專注于動(dòng)植物生命科學(xué)，臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)，人類健康，及藥物研發(fā)等領(lǐng)域的開發(fā)應(yīng)用�，F(xiàn)在公司高通量測序平臺包括 10 臺 HiSeq X、HiSeq 4000、MiSeq、NextSeq 500等平臺，可滿足臨床診療業(yè)務(wù)及科研業(yè)務(wù)不同需求，是基因組學(xué)的首選合作伙伴。HiSeq X Ten是Illumina公司推出的最高通量，最高效率，最低成本的測序系統(tǒng)，首次實(shí)現(xiàn)了將人類基因組重測序成本降低到了1000美金以下。HiSeq X Ten由10臺超高通量測序儀HiSeq X組成，系統(tǒng)單臺儀器每次運(yùn)行可產(chǎn)出高達(dá)1.8Tb的數(shù)據(jù)，測序讀長為2×150b，運(yùn)行時(shí)間為三天以內(nèi)。10臺儀器同時(shí)運(yùn)行時(shí)，每年可完成可超過18000個(gè)人類基因組重測序（30×覆蓋度）。因此，HiSeq X Ten系統(tǒng)將使研究人員更易于開展大規(guī)模人類基因組測序，并將有利于深入挖掘與癌癥及復(fù)雜疾病相關(guān)的遺傳變異。

   宏基因組測序（Metagenomics Sequencing）是對特定環(huán)境（或者特定生境）樣品中的微生物群體基因組進(jìn)行高通量測序，解讀微生物種群結(jié)構(gòu)、多樣性與豐度、基因功能活性、微生物與環(huán)境，微生物與宿主相互協(xié)作關(guān)系。宏基因組測序研究擺脫了微生物分離純培養(yǎng)的限制，擴(kuò)展了微生物資源的利用空間，為環(huán)境微生物群落的研究提供了有效工具。宏基因組測序分為兩種： 一種是對對樣本中全部DNA進(jìn)行建庫并測序，另一種16s rDNA區(qū)段進(jìn)行PCR特異擴(kuò)增后再對擴(kuò)增產(chǎn)物測序。

   16S/18S rDNA測序與宏基因組測序的區(qū)別：16S/18S rRNA基因測序以細(xì)菌16S rRNA 或者真菌18S rRNA 基因測序?yàn)橹?核心是研究樣品中的物種分類、物種豐度以及系統(tǒng)進(jìn)化。宏基因組測序以環(huán)境樣品中的微生物群體基因組為研究對象，直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA，構(gòu)建宏基因組文庫，利用高通量測序技術(shù)分析環(huán)境樣品所包含的全部微生物的群體基因組成及功能和參與的代謝通路，解讀微生物群體的多樣性與豐度，探求微生物與環(huán)境，微生物與宿主之間的關(guān)系，發(fā)掘和研究新的、具有特定功能的基因。

   宏轉(zhuǎn)錄組測序是以環(huán)境中全部RNA作為研究對象，從整體水平上研究某一特定環(huán)境，特定時(shí)期環(huán)境微生物群落的全部基因組轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律，提取環(huán)境微生物群落中的全部轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)行高通量測序，通過信息分析手段揭示微生物在不同環(huán)境條件下的基因調(diào)節(jié)調(diào)控和表達(dá)的差異性，與宏基因組研究相輔相

主要研究對象：

1、人體微生物：口腔、消化道、呼吸道、鼻腔、生殖道、皮膚等部位的微生物；

2、動(dòng)物微生物：瘤胃、昆蟲腸道等部位的微生物；

3、環(huán)境微生物：土壤、海洋、湖水、礦地、極地微生物等；

4、植物內(nèi)生菌：植物的菌根等；

5、工業(yè)微生物：釀酒微生物、發(fā)酵微生物、沼氣微生物等；

6、特殊環(huán)境的微生物：礦井、火山口等環(huán)境微生物。

服務(wù)相關(guān)-樣品要求：

生物信息學(xué)分析內(nèi)容：

宏基因組:

1. 數(shù)據(jù)質(zhì)量評估與過濾
2. 物種鑒定，注釋與分類
3. 物種豐度分析與聚類
4. 多樣品群落結(jié)構(gòu)差異性比較分析

宏轉(zhuǎn)錄組：

1. 數(shù)據(jù)質(zhì)量評估與過濾
2. 基因預(yù)測
3. 基因表達(dá)分析
4. 基因功能注釋
5. 差異性表達(dá)分析
6. GO功能分析和KEGG代謝通路分析

公司簡介：

    世和基因是癌癥個(gè)體化醫(yī)療診斷及高通量測序行業(yè)的先行者與領(lǐng)航者，2008年末一批在生物醫(yī)藥領(lǐng)域有突出貢獻(xiàn)的北美華人科學(xué)家開始致力于高通量全景癌癥基因測序的研究。世和基因生物技術(shù)團(tuán)隊(duì)由多名多倫多大學(xué)，哈佛大學(xué)，斯坦福大學(xué)，新加坡國立大學(xué)，北京大學(xué)及NIH博士和專家組成，專注于高通量測序、癌癥生物學(xué)、生物信息學(xué)領(lǐng)域并擁有豐富的分子遺傳研究及臨床轉(zhuǎn)化經(jīng)驗(yàn)。 世和基因依托雄厚的技術(shù)實(shí)力與世界頂級綜合性醫(yī)院、大學(xué)、研究所攜手生命科學(xué)領(lǐng)域研究，共同推進(jìn)基礎(chǔ)研究向臨床成果轉(zhuǎn)化。同時(shí)，世和基因科研團(tuán)隊(duì)在科研立項(xiàng)、投稿、溝通、修改上處于國際領(lǐng)先水平，至今已發(fā)表高影響因子文獻(xiàn)（20分以上）近10篇，并擁有數(shù)項(xiàng)核心專利。 

世和優(yōu)勢：

1. 嚴(yán)格的質(zhì)量把控

世和基因的測序流程在符合國際標(biāo)準(zhǔn)的臨床實(shí)驗(yàn)室開展，執(zhí)行最嚴(yán)格的質(zhì)量監(jiān)控，完善的實(shí)驗(yàn)流程管理，智能化LIMS報(bào)告系統(tǒng)。

2. 高穩(wěn)定的數(shù)據(jù)輸出

使用illumina原廠進(jìn)口測序試劑，配備了高通量測序所需的全套分子生物學(xué)設(shè)備。世和基因在堿基準(zhǔn)確度、測序均一性、可用數(shù)據(jù)比例等方面的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)均全球遙遙領(lǐng)先。我們不僅承諾lane/flow cell/run 的總數(shù)據(jù)量，還承諾測序數(shù)據(jù)的Q30。

 3. 多樣化的測序平臺

世和基因擁有HiSeq X， HiSeq 4000, MiSeq, NextSeq 500等測序儀，多種測序平臺保證了項(xiàng)目的快速進(jìn)行及靈活性。

4. 強(qiáng)大的技術(shù)支持與生物信息分析團(tuán)隊(duì)

豐富的基因組項(xiàng)目及處理不同樣品的經(jīng)驗(yàn)，技術(shù)支持由國際名校的博士團(tuán)隊(duì)承擔(dān)，強(qiáng)大的生物信息團(tuán)隊(duì)可針對不同項(xiàng)目進(jìn)行深入分析與數(shù)據(jù)挖掘，保證提供最優(yōu)最新最全的解決方案。

5. 價(jià)格優(yōu)勢及短周期

世和基因致力于不斷降低顧客的測序成本，縮短測序周期。我們承諾提供優(yōu)于同行的測序價(jià)格和測序周期。

世和基因中國總部

南京世和基因生物技術(shù)有限公司

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