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高通量測(cè)序服務(wù)-小RNA (Small RNA)
小RNA (Small RNA) 是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長(zhǎng)度在18-30nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問(wèn):844
最后更新:2016-10-18半年訪問(wèn):28
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世和基因--高通量測(cè)序服務(wù)專家

            

   2016年,世和基因引進(jìn)HiSeq X “超級(jí)” 測(cè)序平臺(tái),致力于成為全球領(lǐng)先的基因組學(xué)研究解決方案提供者,專注于動(dòng)植物生命科學(xué),臨床轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué),人類健康,及藥物研發(fā)等領(lǐng)域的開(kāi)發(fā)應(yīng)用,F(xiàn)在公司高通量測(cè)序平臺(tái)包括 10 臺(tái) HiSeq X、HiSeq 4000、MiSeq、NextSeq 500等平臺(tái),可滿足臨床診療業(yè)務(wù)及科研業(yè)務(wù)不同需求,是基因組學(xué)的首選合作伙伴。HiSeq X Ten是Illumina公司推出的最高通量,最高效率,最低成本的測(cè)序系統(tǒng),首次實(shí)現(xiàn)了將人類基因組重測(cè)序成本降低到了1000美金以下。HiSeq X Ten由10臺(tái)超高通量測(cè)序儀HiSeq X組成,系統(tǒng)單臺(tái)儀器每次運(yùn)行可產(chǎn)出高達(dá)1.8Tb的數(shù)據(jù),測(cè)序讀長(zhǎng)為2×150b,運(yùn)行時(shí)間為三天以內(nèi)。10臺(tái)儀器同時(shí)運(yùn)行時(shí),每年可完成可超過(guò)18000個(gè)人類基因組重測(cè)序(30×覆蓋度)。因此,HiSeq X Ten系統(tǒng)將使研究人員更易于開(kāi)展大規(guī)模人類基因組測(cè)序,并將有利于深入挖掘與癌癥及復(fù)雜疾病相關(guān)的遺傳變異。

   小RNA (Small RNA) 是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長(zhǎng)度在18-30nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化,以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過(guò)程。高通量測(cè)序技術(shù)可以對(duì)樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測(cè)序和表達(dá)定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。

                      

服務(wù)相關(guān)-樣品要求

 

樣品類型

總 RNA 樣本

樣品量

≥ 5ug

提取總RNA時(shí),請(qǐng)避免使用過(guò)柱法和LiCl沉淀法,以避免Small RNA的丟失。

樣品質(zhì)量

RNA無(wú)明顯降解,提取的總RNA,OD260/280值在1.8~2.2之間,OD260/230值應(yīng)≥應(yīng)26,濃度≥100 ng/μL,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。

某些來(lái)源樣本(如體液,昆蟲,水生生物樣本等)無(wú)RIN和Ratio28S/18S要求。

樣品保存

RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存。樣品保存期間避免反復(fù)凍融。

樣品運(yùn)輸

置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰運(yùn)輸。

 

生物信息學(xué)分析內(nèi)容

 

  1. 數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估與過(guò)濾
  2. 18~30 nt 小RNA 測(cè)序結(jié)果的長(zhǎng)度分布
  3. 樣品間的共同序列和特異序列的分析
  4. 小RNA在選定的參考基因組上的分布
  5. 小RNA與rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比對(duì)信息
  6. 已知miRNA和novel miRNA的靶基因預(yù)測(cè)
  7. 靶基因GO和KEGG富集分析
  8.  

公司簡(jiǎn)介:

    世和基因是癌癥個(gè)體化醫(yī)療診斷及高通量測(cè)序行業(yè)的先行者與領(lǐng)航者,2008年末一批在生物醫(yī)藥領(lǐng)域有突出貢獻(xiàn)的北美華人科學(xué)家開(kāi)始致力于高通量全景癌癥基因測(cè)序的研究。世和基因生物技術(shù)團(tuán)隊(duì)由多名多倫多大學(xué),哈佛大學(xué),斯坦福大學(xué),新加坡國(guó)立大學(xué),北京大學(xué)及NIH博士和專家組成,專注于高通量測(cè)序、癌癥生物學(xué)、生物信息學(xué)領(lǐng)域并擁有豐富的分子遺傳研究及臨床轉(zhuǎn)化經(jīng)驗(yàn)。 世和基因依托雄厚的技術(shù)實(shí)力與世界頂級(jí)綜合性醫(yī)院、大學(xué)、研究所攜手生命科學(xué)領(lǐng)域研究,共同推進(jìn)基礎(chǔ)研究向臨床成果轉(zhuǎn)化。同時(shí),世和基因科研團(tuán)隊(duì)在科研立項(xiàng)、投稿、溝通、修改上處于國(guó)際領(lǐng)先水平,至今已發(fā)表高影響因子文獻(xiàn)(20分以上)近10篇,并擁有數(shù)項(xiàng)核心專利。 

世和優(yōu)勢(shì):

1. 嚴(yán)格的質(zhì)量把控

世和基因的測(cè)序流程在符合國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)的臨床實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展,執(zhí)行最嚴(yán)格的質(zhì)量監(jiān)控,完善的實(shí)驗(yàn)流程管理,智能化LIMS報(bào)告系統(tǒng)。

2. 高穩(wěn)定的數(shù)據(jù)輸出

使用illumina原廠進(jìn)口測(cè)序試劑,配備了高通量測(cè)序所需的全套分子生物學(xué)設(shè)備。世和基因在堿基準(zhǔn)確度、測(cè)序均一性、可用數(shù)據(jù)比例等方面的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)均全球遙遙領(lǐng)先。我們不僅承諾lane/flow cell/run 的總數(shù)據(jù)量,還承諾測(cè)序數(shù)據(jù)的Q30。

 3. 多樣化的測(cè)序平臺(tái)

世和基因擁有HiSeq X, HiSeq 4000, MiSeq, NextSeq 500等測(cè)序儀,多種測(cè)序平臺(tái)保證了項(xiàng)目的快速進(jìn)行及靈活性。

4. 強(qiáng)大的技術(shù)支持與生物信息分析團(tuán)隊(duì)

豐富的基因組項(xiàng)目及處理不同樣品的經(jīng)驗(yàn),技術(shù)支持由國(guó)際名校的博士團(tuán)隊(duì)承擔(dān),強(qiáng)大的生物信息團(tuán)隊(duì)可針對(duì)不同項(xiàng)目進(jìn)行深入分析與數(shù)據(jù)挖掘,保證提供最優(yōu)最新最全的解決方案。

5. 價(jià)格優(yōu)勢(shì)及短周期

世和基因致力于不斷降低顧客的測(cè)序成本,縮短測(cè)序周期。我們承諾提供優(yōu)于同行的測(cè)序價(jià)格和測(cè)序周期。

 

世和基因中國(guó)總部

南京世和基因生物技術(shù)有限公司

南京高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)新錦湖路3號(hào)-1

中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園02棟18樓

郵編:210061

電話: 400-636-2325

信息咨詢: info@geneseeq.com

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