ChIP技術(shù)揭示NURR1在前列腺癌從基因轉(zhuǎn)錄到腫瘤進(jìn)展中的調(diào)控機(jī)制
前列腺癌(prostatecancer,PCa)是一種常見(jiàn)的惡性腫瘤，其進(jìn)展過(guò)程中常常伴隨著癌癥干細(xì)胞特性的增強(qiáng)、上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT）現(xiàn)象的發(fā)生以及對(duì)傳統(tǒng)治療的抵抗。Wnt/β-catenin信號(hào)通路在胚胎發(fā)育、干細(xì)胞維持以及癌癥進(jìn)展中發(fā)揮重要作用，其異常激活與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。NURR1是一種沒(méi)有配體或目前尚未發(fā)現(xiàn)配體的孤兒核受體蛋白，原本在多巴胺能神經(jīng)元發(fā)育中發(fā)揮關(guān)鍵作用，但近年來(lái)的研究發(fā)現(xiàn)其在多種癌癥中異常表達(dá)，并可能參與癌癥進(jìn)展。然而，NURR1在前列腺癌中的具體作用及其與Wnt/β-catenin信號(hào)通路的關(guān)系尚不清楚。
近日，南方醫(yī)科大學(xué)附屬深圳龍華醫(yī)院泌尿外科副研究員王鑄博士和香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)院Franky Leung Chan合作研究了核受體NURR1（NR4A2）在前列腺癌中的作用機(jī)制，特別是其如何通過(guò)調(diào)控Wnt/β-catenin信號(hào)通路影響前列腺癌的干細(xì)胞特性、EMT以及去勢(shì)抵抗性前列腺癌（castration-resistant prostate cancer, CRPC）的進(jìn)展。研究通過(guò)一系列體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)，結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)（RNA-seq）和表觀遺傳學(xué)技術(shù)（ChIP），揭示了NURR1在前列腺癌中的促癌作用，并提出了其作為潛在治療靶點(diǎn)的可能性。相關(guān)研究成果以《Nuclear receptor NURR1 functions to promote stemness and epithelial-mesenchymal transition in prostate cancer via its targeting of Wnt/β-catenin signaling pathway》為題發(fā)表于《Cell Death & Disease》期刊。深圳易基因?yàn)楸狙芯刻峁y(cè)序分析技術(shù)服務(wù)。
標(biāo)題：Nuclear receptor NURR1 functions to promote stemness and epithelial-mesenchymal transition in prostate cancer via its targeting of Wnt/β-catenin signaling pathway（核受體 NURR1 通過(guò)靶向 Wnt/β-catenin 信號(hào)通路促進(jìn)前列腺癌的干性和上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化）
發(fā)表時(shí)間：2024-3-24
發(fā)表期刊：Cell Death & Disease
影響因子：IF 8.1/Q1
技術(shù)平臺(tái)：RNA-seq、ChIP-qPCR（易基因金牌技術(shù)）
研究摘要
Wnt/β-catenin信號(hào)通路的失調(diào)激活是多種癌癥晚期進(jìn)展中的常見(jiàn)事件。這種信號(hào)激活增強(qiáng)了腫瘤的生長(zhǎng)，并促進(jìn)了轉(zhuǎn)移和治療抵抗。研究表明，該信號(hào)通路在癌癥進(jìn)展過(guò)程中對(duì)細(xì)胞過(guò)程（EMT和癌癥干性）具有雙重調(diào)控作用。Wnt/β-catenin信號(hào)通路的異常激活在前列腺癌以及去勢(shì)抵抗性前列腺癌（CRPC）中較為常見(jiàn)。然而，前列腺癌中該通路的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子尚未得到充分研究。NURR1（NR4A2）是一種孤兒核受體，在多巴胺能神經(jīng)元的發(fā)育中發(fā)揮重要作用。先前研究表明，NURR1在分離的前列腺癌干細(xì)胞（PCSCs）和CRPC異種移植模型中表現(xiàn)出上調(diào)。本研究進(jìn)一步證實(shí)了NURR1在前列腺癌中的上調(diào)，并在前列腺癌細(xì)胞系中表現(xiàn)出增強(qiáng)的表達(dá)。功能和分子分析表明，NURR1能夠通過(guò)直接轉(zhuǎn)錄激活CTNNB1（β-catenin）并激活β-catenin來(lái)介導(dǎo)Wnt/β-catenin信號(hào)通路激活，從而促進(jìn)體外（癌癥干性和EMT）和體內(nèi)前列腺癌細(xì)胞的腫瘤生長(zhǎng)（轉(zhuǎn)移和去勢(shì)抵抗）。此外，本研究還驗(yàn)證了前列腺癌細(xì)胞中NURR1的活性可以通過(guò)小分子進(jìn)行調(diào)控，表明NURR1可能是晚期前列腺癌管理的潛在治療靶點(diǎn)。
研究方法
樣本采集：多種前列腺癌細(xì)胞系（包括LNCaP、VCaP、22Rv1、DU 145和PC-3）、永生化前列腺上皮細(xì)胞系（BPH-1）。此外還利用前列腺組織微陣列（包含良性前列腺增生和不同Gleason評(píng)分的前列腺癌組織）進(jìn)行免疫組化分析。樣本采集涵蓋從細(xì)胞系到臨床組織。
免疫組化和免疫印跡分析：檢測(cè)NURR1在前列腺癌組織和細(xì)胞系中的表達(dá)水平。
RNA測(cè)序（RNA-seq）：通過(guò)對(duì)比NURR1過(guò)表達(dá)和對(duì)照組的前列腺癌細(xì)胞系，分析差異表達(dá)基因，揭示NURR1可能調(diào)控的信號(hào)通路。
染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP-qPCR）：驗(yàn)證NURR1是否直接結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子區(qū)域，從而調(diào)控其表達(dá)。
報(bào)告基因分析和基因編輯技術(shù)：通過(guò)構(gòu)建含CTNNB1啟動(dòng)子的熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒，以及CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因敲除，驗(yàn)證NURR1對(duì)CTNNB1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。
體外和體內(nèi)功能實(shí)驗(yàn)：包括細(xì)胞增殖、遷移、侵襲實(shí)驗(yàn)以及異種移植瘤模型，評(píng)估NURR1對(duì)前列腺癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響。
結(jié)果圖形
（1）NURR1在前列腺癌組織和前列腺癌細(xì)胞中表達(dá)上調(diào)
通過(guò)免疫組化和免疫印跡分析發(fā)現(xiàn)，NURR1在前列腺癌組織和細(xì)胞系中的表達(dá)顯著高于正常前列腺組織和細(xì)胞。
C-D. 前列腺癌組織微陣列中NURR1的免疫組化分析。
E. NURR1免疫印跡分析。多種前列腺癌細(xì)胞系的NURR1表達(dá)水平高于永生化前列腺上皮細(xì)胞BPH-1。
（2）轉(zhuǎn)錄組分析表明NURR1參與Wnt/β-catenin信號(hào)激活
RNA-seq和GSEA分析顯示NURR1過(guò)表達(dá)組中Wnt/β-catenin信號(hào)通路顯著富集。
B. DU 145-NURR1和-Vector感染細(xì)胞以及NURR1高表達(dá)和低表達(dá)組的GSEA結(jié)果，顯示W(wǎng)nt/β-catenin信號(hào)通路的富集情況。
C. 基于NURR1表達(dá)水平將患者分為高表達(dá)和低表達(dá)組，展示TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)患者的RNA-seq數(shù)據(jù)的GSEA氣泡圖。結(jié)果顯示，與NURR1低表達(dá)組相比，NURR1高表達(dá)組中Wnt/β-catenin信號(hào)通路顯著富集。
D. 對(duì)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中的前列腺腺癌數(shù)據(jù)集（PRAD）進(jìn)行表達(dá)分析，結(jié)果顯示NR4A2與CTNNB1在原發(fā)性前列腺癌組織中呈正相關(guān)表達(dá)。
E-F. DU 145-NURR1感染細(xì)胞和DU 145-shNURR1感染細(xì)胞中CTNNB1（β-catenin）表達(dá)的RT-qPCR分析。結(jié)果顯示，與載體或?qū)φ战M相比，DU 145-NURR1感染細(xì)胞中CTNNB1顯著上調(diào)，而DU 145-shNURR1感染細(xì)胞中CTNNB1表達(dá)下調(diào)。
（3）NURR1通過(guò)直接轉(zhuǎn)錄激活CTNNB1來(lái)激活前列腺癌細(xì)胞中的β-catenin信號(hào)通路。
ChIP和報(bào)告基因分析進(jìn)一步證實(shí)NURR1能夠直接結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子并激活其轉(zhuǎn)錄，進(jìn)而增加β-catenin的蛋白表達(dá)和核內(nèi)積累。
B. 熒光素酶報(bào)告基因分析。結(jié)果顯示，只有完整的NURR1，而不是其DNA結(jié)合域缺失突變體NURR1-ΔDBD，能夠以劑量依賴的方式轉(zhuǎn)錄激活CTNNB1啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的報(bào)告基因。然而，NURR1不能轉(zhuǎn)錄激活包含點(diǎn)突變NBRE的報(bào)告基因。
C. 染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）分析。結(jié)果顯示在HEK293細(xì)胞中，CTNNB1啟動(dòng)子上的假定NURR1結(jié)合位點(diǎn)富集了NURR1。IgG作為陰性對(duì)照。
D-E. AR陽(yáng)性（LNCaP、22Rv1）和AR陰性（DU 145）前列腺癌細(xì)胞中β-catenin的免疫印跡分析，這些細(xì)胞分別過(guò)表達(dá)NURR1或敲低NURR1。結(jié)果顯示，LNCaP和DU 145細(xì)胞中NURR1的過(guò)表達(dá)能夠增加總β-catenin及其活性形式（去磷酸化或核內(nèi)）的蛋白水平，而22Rv1和DU 145細(xì)胞中NURR1的敲低則能夠減少這些蛋白水平。然而，在這些前列腺癌細(xì)胞中，NURR1的過(guò)表達(dá)或shRNA敲低并未觀察到非活性或磷酸化β-catenin蛋白水平的顯著變化。
F-G. DU 145和22Rv1細(xì)胞中β-catenin信號(hào)通路下游調(diào)節(jié)因子的免疫印跡分析，這些細(xì)胞經(jīng)過(guò)NURR1激動(dòng)劑C-DIM-12（5 μM）或Wnt抑制劑IWP-2（10 μM）處理。
（4）NURR1可以促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的體外干細(xì)胞特性和EMT
體外實(shí)驗(yàn)表明，NURR1過(guò)表達(dá)能夠增強(qiáng)前列腺癌細(xì)胞的非貼壁生長(zhǎng)能力、遷移和侵襲能力，并誘導(dǎo)EMT相關(guān)標(biāo)志物的表達(dá)變化。
E-F. NURR1和shNURR1感染株及其經(jīng)C-DIM-12或IWP-2處理的感染株中前列腺癌干細(xì)胞（PCSCs）相關(guān)標(biāo)志物的免疫印跡分析。
（5）NURR1可在體內(nèi)促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的去勢(shì)抵抗
圖5：NURR1能夠增強(qiáng)前列腺癌細(xì)胞的體內(nèi)去勢(shì)抵抗性生長(zhǎng)（A、B 體內(nèi)致瘤性實(shí)驗(yàn)）。
A. 顯微照片顯示在去勢(shì)后5周，由VCaP-NURR1和VCaP-載體感染細(xì)胞在宿主小鼠中生長(zhǎng)的異種移植腫瘤，以及經(jīng)過(guò)IWP-2處理的VCaP-NURR1感染細(xì)胞形成的腫瘤。
B. 對(duì)去勢(shì)小鼠中由NURR1感染細(xì)胞形成的異種移植腫瘤大小進(jìn)行半定量分析。
C. 對(duì)VCaP-NURR1感染細(xì)胞形成的去勢(shì)復(fù)發(fā)性異種移植腫瘤進(jìn)行免疫印跡分析。
（6）NURR1可能起到促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞遷移、侵襲和轉(zhuǎn)移潛力的作用
C-D. Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)。
E-F. NURR1和shNURR1感染細(xì)胞中EMT標(biāo)志物的免疫印跡分析。
G. 經(jīng)C-DIM-12/IWP-2處理或聯(lián)合CTNNB1敲除的DU 145-NURR1感染細(xì)胞中EMT標(biāo)志物的免疫印跡分析。
圖7：通過(guò)斑馬魚(yú)胚胎模型驗(yàn)證NURR1能夠增強(qiáng)前列腺癌細(xì)胞的體內(nèi)轉(zhuǎn)移潛力
A. 將RFP（紅色熒光蛋白）標(biāo)記的PC-3-NURR1/載體感染細(xì)胞微注入flk:GFP（綠色熒光蛋白標(biāo)記血管）斑馬魚(yú)胚胎（受精后48小時(shí)）發(fā)育中的心臟區(qū)域。
B. 在注射后第4天，通過(guò)熒光顯微鏡觀察到的PC-3-NURR1/載體感染細(xì)胞在斑馬魚(yú)頭部（頭）和尾部（尾）區(qū)域的遷移情況。綠色代表血管，紅色代表PC-3感染細(xì)胞。顯微鏡觀察顯示，在注射后第4天，PC-3-NURR1感染細(xì)胞在斑馬魚(yú)的頭部和尾部區(qū)域有顯著數(shù)量的細(xì)胞遷移，而PC-3-載體感染細(xì)胞在這些區(qū)域幾乎未被檢測(cè)到。然而，經(jīng)過(guò)C-DIM-12處理的斑馬魚(yú)中檢測(cè)到了大量PC-3-載體感染細(xì)胞。另一方面，CTNNB1敲除的PC-3-NURR1感染細(xì)胞在斑馬魚(yú)的頭部和尾部區(qū)域未被檢測(cè)到，但在血管中有少量細(xì)胞被檢測(cè)到。
C. 對(duì)遷移至斑馬魚(yú)頭部和尾部區(qū)域的PC-3-NURR1/載體感染細(xì)胞進(jìn)行定量分析。
D. 對(duì)遷移到斑馬魚(yú)遠(yuǎn)端部位的PC-3-NURR1/載體感染細(xì)胞中EMT標(biāo)志物的表達(dá)進(jìn)行RT-qPCR分析。結(jié)果顯示，與PC-3-載體感染細(xì)胞相比，遷移的PC-3-NURR1感染細(xì)胞表現(xiàn)出增強(qiáng)的EMT標(biāo)志物表達(dá)特征（SNAIL1和KLF4水平增加，E-鈣粘蛋白水平降低）。用C-DIM-12處理斑馬魚(yú)能夠顯著增加CD44的表達(dá)。CTNNB1敲除的遷移PC-3-NURR1感染細(xì)胞顯示出MMP9表達(dá)降低。
E. NURR1在晚期前列腺癌中通過(guò)直接靶向CTNNB1（β-catenin）促進(jìn)去勢(shì)抵抗性、轉(zhuǎn)移和癌癥干性的作用機(jī)制模式圖。
易小結(jié)
本研究結(jié)果表明，NURR1在前列腺癌中通過(guò)直接調(diào)控CTNNB1的轉(zhuǎn)錄激活Wnt/β-catenin信號(hào)通路，進(jìn)而促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的干細(xì)胞特性、EMT、去勢(shì)抵抗性和轉(zhuǎn)移能力。因此，NURR1及其調(diào)控的Wnt/β-catenin信號(hào)通路可能成為治療前列腺癌的潛在靶點(diǎn)。
RNA-seq和ChIP技術(shù)在本研究中的作用
RNA-seq技術(shù)：用于分析NURR1過(guò)表達(dá)對(duì)前列腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的影響。通過(guò)對(duì)比NURR1過(guò)表達(dá)和對(duì)照組的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，研究人員發(fā)現(xiàn)Wnt/β-catenin信號(hào)通路在NURR1過(guò)表達(dá)組中顯著富集，這提示NURR1可能通過(guò)調(diào)控該信號(hào)通路影響前列腺癌的生物學(xué)行為。
ChIP技術(shù)：用于驗(yàn)證NURR1是否直接結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子區(qū)域。研究人員通過(guò)發(fā)現(xiàn)NURR1能夠特異性地結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子上的一個(gè)特定序列（NBRE），從而為NURR1直接調(diào)控CTNNB1表達(dá)提供了直接證據(jù)。
參考文獻(xiàn)：
Zhang, X., Li, H., Wang, Y. et al. Nuclear receptor NURR1 functions to promote stemness and epithelial-mesenchymal transition in prostate cancer via its targeting of Wnt/β-catenin signaling pathway. Cell Death Dis 15, 234 (2024). https://doi.org/10.1038/s41419-024-06621-w
近日，南方醫(yī)科大學(xué)附屬深圳龍華醫(yī)院泌尿外科副研究員王鑄博士和香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)院Franky Leung Chan合作研究了核受體NURR1（NR4A2）在前列腺癌中的作用機(jī)制，特別是其如何通過(guò)調(diào)控Wnt/β-catenin信號(hào)通路影響前列腺癌的干細(xì)胞特性、EMT以及去勢(shì)抵抗性前列腺癌（castration-resistant prostate cancer, CRPC）的進(jìn)展。研究通過(guò)一系列體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)，結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)（RNA-seq）和表觀遺傳學(xué)技術(shù)（ChIP），揭示了NURR1在前列腺癌中的促癌作用，并提出了其作為潛在治療靶點(diǎn)的可能性。相關(guān)研究成果以《Nuclear receptor NURR1 functions to promote stemness and epithelial-mesenchymal transition in prostate cancer via its targeting of Wnt/β-catenin signaling pathway》為題發(fā)表于《Cell Death & Disease》期刊。深圳易基因?yàn)楸狙芯刻峁y(cè)序分析技術(shù)服務(wù)。
標(biāo)題：Nuclear receptor NURR1 functions to promote stemness and epithelial-mesenchymal transition in prostate cancer via its targeting of Wnt/β-catenin signaling pathway（核受體 NURR1 通過(guò)靶向 Wnt/β-catenin 信號(hào)通路促進(jìn)前列腺癌的干性和上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化）
發(fā)表期刊：Cell Death & Disease
影響因子：IF 8.1/Q1
技術(shù)平臺(tái)：RNA-seq、ChIP-qPCR（易基因金牌技術(shù)）
研究摘要
Wnt/β-catenin信號(hào)通路的失調(diào)激活是多種癌癥晚期進(jìn)展中的常見(jiàn)事件。這種信號(hào)激活增強(qiáng)了腫瘤的生長(zhǎng)，并促進(jìn)了轉(zhuǎn)移和治療抵抗。研究表明，該信號(hào)通路在癌癥進(jìn)展過(guò)程中對(duì)細(xì)胞過(guò)程（EMT和癌癥干性）具有雙重調(diào)控作用。Wnt/β-catenin信號(hào)通路的異常激活在前列腺癌以及去勢(shì)抵抗性前列腺癌（CRPC）中較為常見(jiàn)。然而，前列腺癌中該通路的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子尚未得到充分研究。NURR1（NR4A2）是一種孤兒核受體，在多巴胺能神經(jīng)元的發(fā)育中發(fā)揮重要作用。先前研究表明，NURR1在分離的前列腺癌干細(xì)胞（PCSCs）和CRPC異種移植模型中表現(xiàn)出上調(diào)。本研究進(jìn)一步證實(shí)了NURR1在前列腺癌中的上調(diào)，并在前列腺癌細(xì)胞系中表現(xiàn)出增強(qiáng)的表達(dá)。功能和分子分析表明，NURR1能夠通過(guò)直接轉(zhuǎn)錄激活CTNNB1（β-catenin）并激活β-catenin來(lái)介導(dǎo)Wnt/β-catenin信號(hào)通路激活，從而促進(jìn)體外（癌癥干性和EMT）和體內(nèi)前列腺癌細(xì)胞的腫瘤生長(zhǎng)（轉(zhuǎn)移和去勢(shì)抵抗）。此外，本研究還驗(yàn)證了前列腺癌細(xì)胞中NURR1的活性可以通過(guò)小分子進(jìn)行調(diào)控，表明NURR1可能是晚期前列腺癌管理的潛在治療靶點(diǎn)。
圖形摘要
研究方法
樣本采集：多種前列腺癌細(xì)胞系（包括LNCaP、VCaP、22Rv1、DU 145和PC-3）、永生化前列腺上皮細(xì)胞系（BPH-1）。此外還利用前列腺組織微陣列（包含良性前列腺增生和不同Gleason評(píng)分的前列腺癌組織）進(jìn)行免疫組化分析。樣本采集涵蓋從細(xì)胞系到臨床組織。
免疫組化和免疫印跡分析：檢測(cè)NURR1在前列腺癌組織和細(xì)胞系中的表達(dá)水平。
RNA測(cè)序（RNA-seq）：通過(guò)對(duì)比NURR1過(guò)表達(dá)和對(duì)照組的前列腺癌細(xì)胞系，分析差異表達(dá)基因，揭示NURR1可能調(diào)控的信號(hào)通路。
染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP-qPCR）：驗(yàn)證NURR1是否直接結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子區(qū)域，從而調(diào)控其表達(dá)。
報(bào)告基因分析和基因編輯技術(shù)：通過(guò)構(gòu)建含CTNNB1啟動(dòng)子的熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒，以及CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因敲除，驗(yàn)證NURR1對(duì)CTNNB1的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。
體外和體內(nèi)功能實(shí)驗(yàn)：包括細(xì)胞增殖、遷移、侵襲實(shí)驗(yàn)以及異種移植瘤模型，評(píng)估NURR1對(duì)前列腺癌細(xì)胞生物學(xué)行為的影響。
結(jié)果圖形
（1）NURR1在前列腺癌組織和前列腺癌細(xì)胞中表達(dá)上調(diào)
通過(guò)免疫組化和免疫印跡分析發(fā)現(xiàn)，NURR1在前列腺癌組織和細(xì)胞系中的表達(dá)顯著高于正常前列腺組織和細(xì)胞。
圖1：NURR1在臨床前列腺癌組織和前列腺癌細(xì)胞系中的表達(dá)上調(diào)。
A-B. 通過(guò)對(duì)兩個(gè)臨床前列腺癌組織的微陣列數(shù)據(jù)集進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析，結(jié)果顯示NURR1在前列腺癌中表現(xiàn)出上調(diào)的表達(dá)模式。C-D. 前列腺癌組織微陣列中NURR1的免疫組化分析。
E. NURR1免疫印跡分析。多種前列腺癌細(xì)胞系的NURR1表達(dá)水平高于永生化前列腺上皮細(xì)胞BPH-1。
（2）轉(zhuǎn)錄組分析表明NURR1參與Wnt/β-catenin信號(hào)激活
RNA-seq和GSEA分析顯示NURR1過(guò)表達(dá)組中Wnt/β-catenin信號(hào)通路顯著富集。
圖 2：Wnt/β-catenin信號(hào)通路參與NURR1過(guò)表達(dá)的前列腺癌
A. DU 145-NURR1和-Vector感染細(xì)胞的RNA-seq數(shù)據(jù)的基因集富集分析（GSEA）氣泡圖。結(jié)果顯示，與對(duì)照組（Vector）相比，NURR1過(guò)表達(dá)組（NURR1）中Wnt/β-catenin信號(hào)是最顯著富集通路。B. DU 145-NURR1和-Vector感染細(xì)胞以及NURR1高表達(dá)和低表達(dá)組的GSEA結(jié)果，顯示W(wǎng)nt/β-catenin信號(hào)通路的富集情況。
C. 基于NURR1表達(dá)水平將患者分為高表達(dá)和低表達(dá)組，展示TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)患者的RNA-seq數(shù)據(jù)的GSEA氣泡圖。結(jié)果顯示，與NURR1低表達(dá)組相比，NURR1高表達(dá)組中Wnt/β-catenin信號(hào)通路顯著富集。
D. 對(duì)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中的前列腺腺癌數(shù)據(jù)集（PRAD）進(jìn)行表達(dá)分析，結(jié)果顯示NR4A2與CTNNB1在原發(fā)性前列腺癌組織中呈正相關(guān)表達(dá)。
E-F. DU 145-NURR1感染細(xì)胞和DU 145-shNURR1感染細(xì)胞中CTNNB1（β-catenin）表達(dá)的RT-qPCR分析。結(jié)果顯示，與載體或?qū)φ战M相比，DU 145-NURR1感染細(xì)胞中CTNNB1顯著上調(diào)，而DU 145-shNURR1感染細(xì)胞中CTNNB1表達(dá)下調(diào)。
（3）NURR1通過(guò)直接轉(zhuǎn)錄激活CTNNB1來(lái)激活前列腺癌細(xì)胞中的β-catenin信號(hào)通路。
ChIP和報(bào)告基因分析進(jìn)一步證實(shí)NURR1能夠直接結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子并激活其轉(zhuǎn)錄，進(jìn)而增加β-catenin的蛋白表達(dá)和核內(nèi)積累。
圖3：NURR1可以通過(guò)直接轉(zhuǎn)錄激活CTNNB1以及激活β-catenin來(lái)激活前列腺癌細(xì)胞中的Wnt/β-catenin信號(hào)通路
A. CTNNB1啟動(dòng)子的1.3 kb片段驅(qū)動(dòng)的報(bào)告基因構(gòu)建示意圖，以及三個(gè)包含點(diǎn)突變NBRE的報(bào)告基因構(gòu)建。B. 熒光素酶報(bào)告基因分析。結(jié)果顯示，只有完整的NURR1，而不是其DNA結(jié)合域缺失突變體NURR1-ΔDBD，能夠以劑量依賴的方式轉(zhuǎn)錄激活CTNNB1啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的報(bào)告基因。然而，NURR1不能轉(zhuǎn)錄激活包含點(diǎn)突變NBRE的報(bào)告基因。
C. 染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）分析。結(jié)果顯示在HEK293細(xì)胞中，CTNNB1啟動(dòng)子上的假定NURR1結(jié)合位點(diǎn)富集了NURR1。IgG作為陰性對(duì)照。
D-E. AR陽(yáng)性（LNCaP、22Rv1）和AR陰性（DU 145）前列腺癌細(xì)胞中β-catenin的免疫印跡分析，這些細(xì)胞分別過(guò)表達(dá)NURR1或敲低NURR1。結(jié)果顯示，LNCaP和DU 145細(xì)胞中NURR1的過(guò)表達(dá)能夠增加總β-catenin及其活性形式（去磷酸化或核內(nèi)）的蛋白水平，而22Rv1和DU 145細(xì)胞中NURR1的敲低則能夠減少這些蛋白水平。然而，在這些前列腺癌細(xì)胞中，NURR1的過(guò)表達(dá)或shRNA敲低并未觀察到非活性或磷酸化β-catenin蛋白水平的顯著變化。
F-G. DU 145和22Rv1細(xì)胞中β-catenin信號(hào)通路下游調(diào)節(jié)因子的免疫印跡分析，這些細(xì)胞經(jīng)過(guò)NURR1激動(dòng)劑C-DIM-12（5 μM）或Wnt抑制劑IWP-2（10 μM）處理。
（4）NURR1可以促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的體外干細(xì)胞特性和EMT
體外實(shí)驗(yàn)表明，NURR1過(guò)表達(dá)能夠增強(qiáng)前列腺癌細(xì)胞的非貼壁生長(zhǎng)能力、遷移和侵襲能力，并誘導(dǎo)EMT相關(guān)標(biāo)志物的表達(dá)變化。
圖4：NURR1能夠增強(qiáng)前列腺癌細(xì)胞的體外干細(xì)胞特性。
A-D. 非貼壁3D培養(yǎng)球體形成實(shí)驗(yàn)。E-F. NURR1和shNURR1感染株及其經(jīng)C-DIM-12或IWP-2處理的感染株中前列腺癌干細(xì)胞（PCSCs）相關(guān)標(biāo)志物的免疫印跡分析。
（5）NURR1可在體內(nèi)促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的去勢(shì)抵抗
圖5：NURR1能夠增強(qiáng)前列腺癌細(xì)胞的體內(nèi)去勢(shì)抵抗性生長(zhǎng)（A、B 體內(nèi)致瘤性實(shí)驗(yàn)）。
B. 對(duì)去勢(shì)小鼠中由NURR1感染細(xì)胞形成的異種移植腫瘤大小進(jìn)行半定量分析。
C. 對(duì)VCaP-NURR1感染細(xì)胞形成的去勢(shì)復(fù)發(fā)性異種移植腫瘤進(jìn)行免疫印跡分析。
（6）NURR1可能起到促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞遷移、侵襲和轉(zhuǎn)移潛力的作用
圖6：NURR1能夠促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的體外遷移和侵襲能力
A-B. 劃痕愈合實(shí)驗(yàn)。C-D. Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)。
E-F. NURR1和shNURR1感染細(xì)胞中EMT標(biāo)志物的免疫印跡分析。
G. 經(jīng)C-DIM-12/IWP-2處理或聯(lián)合CTNNB1敲除的DU 145-NURR1感染細(xì)胞中EMT標(biāo)志物的免疫印跡分析。
圖7：通過(guò)斑馬魚(yú)胚胎模型驗(yàn)證NURR1能夠增強(qiáng)前列腺癌細(xì)胞的體內(nèi)轉(zhuǎn)移潛力
B. 在注射后第4天，通過(guò)熒光顯微鏡觀察到的PC-3-NURR1/載體感染細(xì)胞在斑馬魚(yú)頭部（頭）和尾部（尾）區(qū)域的遷移情況。綠色代表血管，紅色代表PC-3感染細(xì)胞。顯微鏡觀察顯示，在注射后第4天，PC-3-NURR1感染細(xì)胞在斑馬魚(yú)的頭部和尾部區(qū)域有顯著數(shù)量的細(xì)胞遷移，而PC-3-載體感染細(xì)胞在這些區(qū)域幾乎未被檢測(cè)到。然而，經(jīng)過(guò)C-DIM-12處理的斑馬魚(yú)中檢測(cè)到了大量PC-3-載體感染細(xì)胞。另一方面，CTNNB1敲除的PC-3-NURR1感染細(xì)胞在斑馬魚(yú)的頭部和尾部區(qū)域未被檢測(cè)到，但在血管中有少量細(xì)胞被檢測(cè)到。
C. 對(duì)遷移至斑馬魚(yú)頭部和尾部區(qū)域的PC-3-NURR1/載體感染細(xì)胞進(jìn)行定量分析。
D. 對(duì)遷移到斑馬魚(yú)遠(yuǎn)端部位的PC-3-NURR1/載體感染細(xì)胞中EMT標(biāo)志物的表達(dá)進(jìn)行RT-qPCR分析。結(jié)果顯示，與PC-3-載體感染細(xì)胞相比，遷移的PC-3-NURR1感染細(xì)胞表現(xiàn)出增強(qiáng)的EMT標(biāo)志物表達(dá)特征（SNAIL1和KLF4水平增加，E-鈣粘蛋白水平降低）。用C-DIM-12處理斑馬魚(yú)能夠顯著增加CD44的表達(dá)。CTNNB1敲除的遷移PC-3-NURR1感染細(xì)胞顯示出MMP9表達(dá)降低。
E. NURR1在晚期前列腺癌中通過(guò)直接靶向CTNNB1（β-catenin）促進(jìn)去勢(shì)抵抗性、轉(zhuǎn)移和癌癥干性的作用機(jī)制模式圖。
易小結(jié)
本研究結(jié)果表明，NURR1在前列腺癌中通過(guò)直接調(diào)控CTNNB1的轉(zhuǎn)錄激活Wnt/β-catenin信號(hào)通路，進(jìn)而促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的干細(xì)胞特性、EMT、去勢(shì)抵抗性和轉(zhuǎn)移能力。因此，NURR1及其調(diào)控的Wnt/β-catenin信號(hào)通路可能成為治療前列腺癌的潛在靶點(diǎn)。
RNA-seq和ChIP技術(shù)在本研究中的作用
RNA-seq技術(shù)：用于分析NURR1過(guò)表達(dá)對(duì)前列腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的影響。通過(guò)對(duì)比NURR1過(guò)表達(dá)和對(duì)照組的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，研究人員發(fā)現(xiàn)Wnt/β-catenin信號(hào)通路在NURR1過(guò)表達(dá)組中顯著富集，這提示NURR1可能通過(guò)調(diào)控該信號(hào)通路影響前列腺癌的生物學(xué)行為。
ChIP技術(shù)：用于驗(yàn)證NURR1是否直接結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子區(qū)域。研究人員通過(guò)發(fā)現(xiàn)NURR1能夠特異性地結(jié)合到CTNNB1啟動(dòng)子上的一個(gè)特定序列（NBRE），從而為NURR1直接調(diào)控CTNNB1表達(dá)提供了直接證據(jù)。
參考文獻(xiàn)：
Zhang, X., Li, H., Wang, Y. et al. Nuclear receptor NURR1 functions to promote stemness and epithelial-mesenchymal transition in prostate cancer via its targeting of Wnt/β-catenin signaling pathway. Cell Death Dis 15, 234 (2024). https://doi.org/10.1038/s41419-024-06621-w
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