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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組二代+三代測序
二代測序與三代測序相結(jié)合,能夠在成本適中的前提下,既獲得轉(zhuǎn)錄本的全長序列,又能夠通過Cell Barcode信息定位到細(xì)胞亞群。
服務(wù)類別:測序/合成總訪問:288
最后更新:2023-2-2半年訪問:31
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在單細(xì)胞二代測序的基礎(chǔ)上,新格元推出單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組二代+三代測序方案。新增全長檢測的三代測序,分析內(nèi)容包括SNP/CNV、基因可變剪切、TCR/BCR全長檢測、轉(zhuǎn)錄本isoform等。能夠在單細(xì)胞水平上研究關(guān)鍵基因的轉(zhuǎn)錄本并發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本或關(guān)鍵基因的新的可變剪切類型,在遺傳發(fā)育、腫瘤發(fā)生等方向有著重要應(yīng)用。

新格元單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組二代+三代解決方案,利用GEXSCOPE®平臺(tái)對(duì)單細(xì)胞mRNA捕獲后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄生成cDNA,利用同一份cDNA分成兩部分,分別構(gòu)建二代測序文庫和三代測序文庫,流程優(yōu)化簡單,二、三代單細(xì)胞優(yōu)勢互補(bǔ),大幅降低整體實(shí)驗(yàn)成本,為單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄組測序提供了一站式解決方案。并且在數(shù)據(jù)分析上相較于單獨(dú)的單細(xì)胞二代或三代測序,單細(xì)胞二代+三代能夠得到更加精細(xì)的細(xì)胞聚類和細(xì)胞注釋。三代測序的超長讀長,可獲得mRNA全長序列及結(jié)構(gòu)信息。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組二代+三代測序的潛在應(yīng)用范圍廣泛,目前已成功應(yīng)用于識(shí)別細(xì)胞周期、腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性研究、鑒定罕見細(xì)胞類型、免疫細(xì)胞分型、干細(xì)胞分型、疾病分型等領(lǐng)域。

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