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MassARRAY® DNA 甲基化分析定制服務
MassARRAY®EpiTYPER™ DNA 甲基化分析技術結合了堿基特異性酶切反應和 MALDI-TOF 檢測原理用于DNA 甲基化定量分析。
服務類別:芯片與生物信息學總訪問:5861
最后更新:2015-1-16半年訪問:96
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MassARRAY®EpiTYPER™ DNA 甲基化分析技術結合了堿基特異性酶切反應和 MALDI-TOF 檢測原理用于DNA 甲基化定量分析。可實現多重 CpG 的分析檢測,是用于 DNA 甲基化定量分析及在基因組任何區(qū)域或者候選基因中鑒定甲基化定量分析的首選方法。

堿基特異性酶切(MassCLEAVE)實驗由亞硫酸鹽處理待測 DNA 開始。經過亞硫酸鹽處理,DNA中的未甲基化的胞嘧啶 (C) 轉變?yōu)槟蜞奏ぃ║),由此在 DNA 模板中產生甲基化特異的序列變化。利用 5' 末端帶有T7-啟動子的引物進行 PCR 擴增,產物經 SAP (蝦堿性磷酸酶)處理后用于堿基特異性的酶切反應。酶切后 DNA 片段的大小和分子量取決于亞硫酸鹽處理后的堿基變化,飛行質譜能測出每個片段的分子量,配套軟件 EpiTYPER 則能自動報告每個相應片段的甲基化程度。
 
服務流程
   客戶提供 DNA 或者生物樣本
   樣本前處理
   PCR 擴增、SAP、Transcription、Cleavage
   點樣
   質譜檢測
   分析報告
 
技術特點
   高性能
●   能夠分析覆蓋長達 600bp 的多個 CpG 位點
●   能夠分析福爾馬林處理的石蠟組織
●   無需任何熒光標記
   高靈敏度
●   精度高(5%CV)
●   檢測低至 5% 的甲基化水平
●   分析需要的起始樣本量少(<5pg)
   高性價比
●   用384孔板進行 PCR 反應
●   一個擴增產物可以進行多重 CpG位點分析
●   無需后續(xù)驗證,可直接發(fā)表結果
   操作簡便
●   無需設計 CpG 位點特異性引物
●   無需進行 PCR 產物純化
●   研究幾個到幾百個甲基化位點的理想手段
 
參考文獻
   HEIJMANS, B., et al. (2007) “Heritable rather than age-related environmental and stochastic factors dominate variation in DNA methylation of the human 1GF2/H19 locus” Hum Mol Genet 16(5):547-54.
   RAVAL, A., et al. (2007). “Downregulation of Death-Associated Protein Kinase 1(DAPK1) in chronic lymphocytic leukemia.” Cell 129: 879-90.
   RICHTER, E., et al. (2007). “A role for DNA methylation in regulating the growth suppressor PMEPA1 gene in prostate cancer.” Epigenetics 2(2):100-105.
 
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