技術(shù)服務(wù)6-------ISSR/簡(jiǎn)單重復(fù)序列間擴(kuò)增

ISSR ( inter simple sequence repeat) 又稱簡(jiǎn)單重復(fù)序列間擴(kuò)增，是近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的一類新型的分子標(biāo)記技術(shù)。該技術(shù)根據(jù)植物基因組中豐富的簡(jiǎn)單重復(fù)序列設(shè)計(jì)單一引物,對(duì)基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增,利用了RAPD技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)和基因組中豐富的SSR序列信息,具有操作簡(jiǎn)單、可靠性強(qiáng)、重復(fù)性高、DNA模板用量少、不需預(yù)先設(shè)計(jì)引物的特點(diǎn),可用來(lái)揭示樣本間的遺傳多樣性。
1）PCR-ISSR實(shí)驗(yàn)路線
前期確認(rèn)階段：試驗(yàn)樣本類型，數(shù)量，引物，簽訂試驗(yàn)合作合同；
試驗(yàn)費(fèi)用：DNA提取30元一個(gè)樣本，PCR+電泳檢測(cè)15元一個(gè)反應(yīng)，分析單獨(dú)收費(fèi)（視工作量而定）；23個(gè)樣本，10對(duì)引物包括引物篩選試驗(yàn)費(fèi)用大約5000元。
試驗(yàn)階段：DNA提取，PCR擴(kuò)增，電泳檢測(cè)
數(shù)據(jù)分析：和客戶詳細(xì)溝通，確認(rèn)分析方案：讀取01矩陣；聚類分析；多樣性分析；多態(tài)位點(diǎn)數(shù)(AP) 、多態(tài)位點(diǎn)百分率( P) 、平均等位基因數(shù)(N a) 、有效等位基因數(shù)(N e) 、Nei′s基因多樣性指數(shù)(H) 、Shannon′s信息指數(shù)( I) 、遺傳分化度(Gst)等。利用NTSYS進(jìn)行聚類分析。
2）客戶須知：
本公司需要簽訂技術(shù)服務(wù)合作合同；
本公司再試驗(yàn)結(jié)束后，如沒(méi)要求，試驗(yàn)樣本將統(tǒng)一銷毀；
本公司不接受具有致病性和潛在危險(xiǎn)的原始樣本，此類樣本請(qǐng)您提供樣本DNA。