免疫印跡(Western blot, WB)是分子生物學(xué)中檢測復(fù)雜生物提取物中特定蛋白質(zhì)存在的最常用方法之一。WB必須控制上樣量以確保目標(biāo)蛋白變化具有可比性,通常選擇在所有組織中普遍分布的具有相對(duì)恒定量的蛋白質(zhì)作為內(nèi)參(Loading control)。
01 為何要選用內(nèi)參
在Western Blotting中使用內(nèi)參就是在試驗(yàn)中另外用內(nèi)參對(duì)應(yīng)的抗體檢測內(nèi)參蛋白。內(nèi)參就是內(nèi)部參照,一般是指管家基因編碼表達(dá)的蛋白,它們?cè)诟鱾(gè)組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對(duì)恒定,在檢測蛋白的表達(dá)水平變化時(shí)常用它來做參照。
02 如何選擇內(nèi)參抗體
1、樣本種屬來源
選擇內(nèi)參首先要考慮的就是實(shí)驗(yàn)樣本來源于什么物種。哺乳動(dòng)物的組織或者細(xì)胞樣本,通常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH、Lamin B、Na+/K+-ATPase, Histone H3 等。植物來源實(shí)驗(yàn)樣本,則可以選擇Plant actin、Rubisco等。其他來源樣本研究較少,所以就應(yīng)該參照文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo),選擇合適的蛋白作為內(nèi)參。
2、目的蛋白分子量
選擇內(nèi)參抗體時(shí),應(yīng)該考慮目的蛋白分子量的大小。通常應(yīng)該保證目的蛋白與內(nèi)參蛋白分子量相差5KD以上。比如檢測目的蛋白分子量為45KD,此時(shí)不適宜選擇β-actin(42KD)作為內(nèi)參,可以考慮選擇GAPDH(36KD)作為內(nèi)參。
3、目的蛋白表達(dá)部位
就一般的蛋白檢測來說,β-actin、β-Tubulin抗體等就可以了,而針對(duì)于核蛋白的定量,特別是樣本蛋白就是核蛋白時(shí),選擇恰當(dāng)?shù)暮说鞍變?nèi)參則更能體現(xiàn)內(nèi)部參照的價(jià)值。常用的核內(nèi)參抗體有Lamin A、Lamin B、Histone H3,除此之外,其它常見的核蛋白內(nèi)參還有PCNA、K70、K80等,在一些文獻(xiàn)報(bào)道中,Erk2、TATA binding protein(TBP)以及c-Jun、c-Fos等都有使用。而對(duì)于膜蛋白檢測,常用的內(nèi)參抗體為Na,K ATPase。對(duì)于線粒體蛋白的檢測,常用VDAC1和COX IV作為內(nèi)參抗體。
內(nèi)參的選擇需要考慮實(shí)際的試驗(yàn)環(huán)境,比如某些細(xì)胞中,由于組織缺氧、糖尿病等因素會(huì)導(dǎo)致GAPDH的表達(dá)增高,不適合做內(nèi)參。比如在在凋亡實(shí)驗(yàn)時(shí),Lamin等也不適合作為內(nèi)參。因此設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案的時(shí)候應(yīng)該考慮這些因素并查詢相應(yīng)文獻(xiàn),在實(shí)驗(yàn)過程中也應(yīng)該注意如果內(nèi)參表達(dá)出現(xiàn)異常,應(yīng)考慮這方面因素。
03 斯達(dá)特內(nèi)參抗體
1、如何選擇您的內(nèi)參抗體
2、斯達(dá)特內(nèi)參抗體清單