SPT Labtech mosquito HV genomics在COVID-19 NGS檢測中的應(yīng)用

導(dǎo)語
Helix公司成立于2015年，作為“基因APP Store”的開創(chuàng)者，是測序巨頭Illumina旗下的一家子公司，疫情期間Helix獲得FDA應(yīng)急使用授權(quán)（EUA），可以使用基于NGS的COVID-19檢測。  
Helix的體外診斷試驗旨在檢測鼻咽拭子、口咽拭子等上呼吸道標(biāo)本中SARS-CoV-2 刺突蛋白(S)基因(以及人內(nèi)參RPP30)。
 
Helix的CLIA / CAP實驗室平臺，將提供基于Illumina NovaSeq 6000的NGS檢測。該檢測方法使用Thermo Fisher Scientific公司提供的RNA提取和反轉(zhuǎn)擴(kuò)增試劑，以及Integrated DNA Technologies公司的定制引物。FDA應(yīng)急使用授權(quán)中規(guī)定，Helix COVID-19 NGS檢測可使用SPT Labtech mosquito HV genomics移液工作站進(jìn)行液體處理。
 
Helix已從美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）的RADx計劃中獲得了3340萬美元的資金支持，成為美國COVID-19“超級實驗室”之一 。
 
Helix的CEO Marc Stapley表示“在全國范圍內(nèi)進(jìn)行更快速、更可靠的COVID-19檢測是現(xiàn)在迫切需要的。通過NIH的資助，將使Helix能夠迅速擴(kuò)大規(guī)模，高通量的檢測方法和先進(jìn)的實驗室設(shè)施可以達(dá)到每天10萬份樣本的檢測量，使其成為美國最高通量的COVID-19實驗室之一�！�  
此外Helix與加州大學(xué)圣地亞哥分校（UCSD）合作進(jìn)行了COVID-19多重?zé)晒舛�量PCR（multiplex real time RT-PCR）檢測，使用了TaqPath COVID-19 CE-IVD RT-PCR試劑盒，利用了mosquito添加1μL PCR mix和2μL RNA樣本，最終將反應(yīng)體系從25μL微縮化至3μL，每個樣本節(jié)省了8倍的成本！    
SPT Labtech公司的mosquito genomics移液工作站憑借其小體系加樣的精準(zhǔn)度和穩(wěn)定表現(xiàn)，已成為眾多基因組學(xué)實驗室的理想選擇。其獨有的固相置換技術(shù)，可以無視任何黏度的試劑或DNA，對25nL-5μL樣品進(jìn)行精確加樣，并且不需要進(jìn)行任何液體參數(shù)的調(diào)整。
 
它正在改變基因組學(xué)實驗室的工作方式——mosquito能夠精確地在傳統(tǒng)實驗體積的一小部分(通常不到1/10)建立反應(yīng)體系，從而大幅減少試劑成本，提高檢測通量。
 
舉個栗子：例如高昂的SMART-seq HT（Clontech）試劑盒，將反應(yīng)體系從25μL降低至2.5μL后，每個樣品可以節(jié)省250元人民幣，一塊384孔板可以節(jié)省高達(dá)8萬多元的試劑成本!  而使用mosquito genomics，同樣一個試劑盒，可以使用更多的次數(shù)。這解決了大部分實驗室科學(xué)家的心結(jié)，避免了被試劑盒拿捏的死死的尬尷！
 
目前單細(xì)胞測序cDNA合成和擴(kuò)增、文庫構(gòu)建、PCR/qPCR體系建立等實驗均已成功在mosquito上實現(xiàn)微縮化和自動化的流程建立。