浙江大學蛋白質(zhì)組學專題研習班（第7期）通知

各高校及相關(guān)科研單位：
蛋白質(zhì)組學研究是生命科學的新興前沿領(lǐng)域，是生命科學進入后基因組時代的標志之一。近年來，隨著蛋白質(zhì)組學、生物信息學與質(zhì)譜分析技術(shù)的快速發(fā)展，誕生了一系列與蛋白質(zhì)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫資源及生物信息學分析工具，在研究蛋白質(zhì)的鑒定、結(jié)構(gòu)分析與模擬、蛋白與核酸相互作用、與蛋白-蛋白相互作用、分子對接，乃至分子相互作用網(wǎng)絡(luò)等各個層面為科學研究提供助力。

為進一步幫助廣大科研工作者快速掌握提升蛋白質(zhì)組學原理、實驗設(shè)計以及后期數(shù)據(jù)分析技能，浙江大學歷經(jīng)20年的“基因組科學研習班”品牌項目原班人馬聯(lián)合浙江大學多位長期從事蛋白質(zhì)組學研究的老師及景杰生物資深生信專家傾情推出“蛋白質(zhì)組學專題研習班”，通過理論授課與上機實踐相結(jié)合的方式，每人一臺PC機，緊隨大屏幕演示“跟我學”操作。
 
培訓內(nèi)容：蛋白質(zhì)組學背景介紹、質(zhì)譜分析基礎(chǔ)、蛋白組學實驗基礎(chǔ)與思路、蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)處理、MaxQuant蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)處理（上機實踐）、蛋白組組學生物信息學分析、蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析及可視化（上機實踐）、蛋白質(zhì)組學功能數(shù)據(jù)的挖掘（上機實踐）、蛋白質(zhì)組學研究案例說明等。
培訓時間：2023年12月18-22日（18日為報到日，19日起上課）。
培訓對象：從事生命科學、農(nóng)學、醫(yī)學等領(lǐng)域科研工作者和高校教師及研究生。
培訓地點：杭州 浙江大學  
注冊方式：
（1）培訓費：4200元/人（包含注冊費、資料費、上機實踐費）。
培訓期間食宿自理，會務(wù)組可幫助預(yù)定。
（2）繳費方式（指定賬號）
賬戶名稱：浙江大學
賬戶號（開戶行）：19042201040000014（農(nóng)行杭州市浙大支行紫金港分理處）
匯款用途處寫明：姓名+上機號（由會務(wù)組在回執(zhí)確認函中提供）
（3）會務(wù)組聯(lián)系方式：
余老師 19116332108  沈老師 13958194424
會務(wù)組郵箱： genetrain@sina.com、genetrain@zju.edu.cn
填寫報名表并于報到前發(fā)送至會務(wù)組郵箱，上機實踐主辦方配備電腦。如有其它要求，請在備注中說明。
（4）非匯款學員可現(xiàn)場刷卡（含公務(wù)卡）或現(xiàn)金交納
（5）研習班期間食宿費用自理，會務(wù)組可以代為預(yù)定住宿，您也可自行安排住宿。
a,漢庭酒店（浙大紫金港店），浙江省杭州市西湖區(qū)紫荊花北路188號(近浙江大學紫金港校區(qū))。標準間房價：260元/間/天（含早）；
b,紫金港國際飯店，浙江省杭州市西湖區(qū)申花路796號(近浙江大學紫金港校區(qū))。標準間房價：398元/間/天（含早）；

證書發(fā)放：
 

日 期	時 間	內(nèi) 容 安 排
12月18日（2023年）	全   天	杭州 浙江大學紫金港校區(qū)報到（詳見報到通知）
19日 （周二）	08:30~11:30	蛋白質(zhì)組學背景介紹 系統(tǒng)生物學與蛋白組學發(fā)展史 蛋白組的復(fù)雜性與動態(tài)變化特征 蛋白組學研究展望
	14:00~17:00	質(zhì)譜分析基礎(chǔ) 質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展與常見質(zhì)譜類型簡介 質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集與譜圖解析 多肽的質(zhì)譜定性定量分析
20日 （周三）	08:30~11:30	蛋白組學實驗基礎(chǔ)與思路 常見比較蛋白組學流程與設(shè)計思路 常見樣本處理流程 特殊樣本的處理流程 標記與非標記策略 多肽的分級與分離 其他樣本前處理策略
	14:00~17:00	MaxQuant蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)處理（上機實踐） MaxQuant軟件及數(shù)據(jù)處理流程介紹 LFQ、iBAQ、譜圖計數(shù)法非標定量 SILAC標記定量 TMT標記定量 結(jié)果查看與導(dǎo)出 Persues統(tǒng)計處理與可視化
21日 （周四）	08:30~11:30	蛋白質(zhì)組學功能數(shù)據(jù)的挖掘（上機實踐） R語言基礎(chǔ) GO與KEGG通路分析 基于String數(shù)據(jù)庫的蛋白互作分析 基于Cytoscape的互相作用可視化
	14:00~17:00	蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析及可視化（上機實踐） GSEA功能富集分析 磷酸化激酶預(yù)測分析 泛素化E3連接酶預(yù)測分析 藥物靶預(yù)測分析 蛋白三維結(jié)構(gòu)與口袋預(yù)測
22日 （周五）	08:30~11:30	蛋白組組學生物信息學分析 蛋白質(zhì)功能注釋 蛋白質(zhì)組學標準分析 蛋白質(zhì)組學臨床應(yīng)用 蛋白修飾組學分析 多組學聯(lián)合分析
	14:00~17:00	蛋白質(zhì)組學研究案例說明 從科學問題到研究閉環(huán) 臨床大樣本與分子分型-以大隊列研究為例 翻譯后修飾與腫瘤代謝-以新型�；�修飾為例 蛋白質(zhì)組未來應(yīng)用展望

   
鐘伯雄  教授 博士生導(dǎo)師
浙江大學動物科學學院教授，開展了家蠶絲腺蛋白質(zhì)組、以及與野蠶后部絲腺的比較蛋白質(zhì)組學研究，發(fā)現(xiàn)蠶繭優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)主要是核糖體蛋白代謝通路提高；（2）開展了蛋白翻譯后修飾研究，明確了與蠶繭優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)相關(guān)的蛋白質(zhì)磷酸化特征；（3）建立了高效轉(zhuǎn)基因方法，采用TALEN技術(shù)在家蠶胚胎時期成功獲得基因定點插入研究結(jié)果、采用CRISPR-Cas9技術(shù)成功突變家蠶重要功能基因，獲得穩(wěn)定遺傳突變品種（4）開展了micRNA研究工作，揭示了家蠶絲腺micRNA表達特征。（5）開展了家蠶生物反應(yīng)器研究，獲得了機械性能優(yōu)良的家蠶蜘蛛復(fù)合絲新材料。在JPR、BMC Genomics、IBMB、遺傳學報、蠶業(yè)科學等國內(nèi)外雜志發(fā)表相關(guān)論文160多篇。
 
郭  成 副研究員  碩士生導(dǎo)師。
以第一作者/通訊作者在Analytical Chemistry, Analytica Chimica Acta等期刊上發(fā)表SCI論文28篇，以合作作者身份在Nature，JACS等期刊上發(fā)表SCI論文多篇。ACS等出版社十余種SCI期刊審稿人。承擔國家自然科學基金面上項目、青年基金、浙江省自然科學基金等科研項目多項，作為科研骨干參與國家自然科學基金杰出青年基金、重點項目等。
 
趙祖相嵐 博士
哈爾濱醫(yī)科大學生物信息學碩士，博士畢業(yè)于澳門大學生物醫(yī)學專業(yè)，研究方向為乳腺癌單細胞測序分析，蛋白因子調(diào)控與激素作用機制。具有多年組學分析經(jīng)驗，擅長課題方案設(shè)計、生物信息學分析思路規(guī)劃。目前主要從事臨床腫瘤大樣本蛋白基因組、翻譯后修飾調(diào)控、多種修飾crosstalk等方向的研究。在多組學聯(lián)合分析、蛋白基因組建庫、生信算法整合、分析流程搭建、數(shù)據(jù)挖掘與機制探索等方面具有豐富的理論基礎(chǔ)與實踐經(jīng)驗。數(shù)據(jù)分析與方法學論文主要發(fā)表在Cell reports, EMBO reports, BMC bioinformatics, Nuclear Acid Research, Oncogene等雜志。
 
孫強強 博士
博士畢業(yè)于武漢大學，博士期間從事感染免疫、抗感染治療機制研究。在蛋白組學、空間組學、多組學及蛋白質(zhì)翻譯后修飾等領(lǐng)域有豐富的研究及項目經(jīng)驗。闡明了迄今為止發(fā)現(xiàn)的第一個同時調(diào)節(jié)病原體乳酸代謝及免疫逃逸的轉(zhuǎn)錄因子，并解釋了代謝途徑調(diào)節(jié)模式如何根據(jù)不同宿主生態(tài)位演變，對預(yù)防和治療感染提供了重要的理論和醫(yī)療意義，并為新型藥物開發(fā)提供了潛在的靶點。目前，學術(shù)論文在Nature Communications, eLife, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Molecular Microbiology等發(fā)表。
 
張佳輝 高級工程師
福建醫(yī)科大學獲得生物信息學碩士學位。主要課題利用基因表達相對穩(wěn)定的秩序關(guān)系尋找消化道腫瘤早期診斷、預(yù)后相關(guān)的biomarker。累計參與大型分析項目30余個，學術(shù)論文共同作者15余篇。從事多組學相關(guān)的生信工作近5年，具有大量多組學數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗，涉及多癌型、單一癌型不同亞型、多器官、不同生理發(fā)育階段等。對數(shù)據(jù)挖掘及作圖可視化有豐富實戰(zhàn)經(jīng)驗，合作文章產(chǎn)出累計影響因子達80+。
 
趙二杰 高級工程師
畢業(yè)于哈爾濱醫(yī)科大學基礎(chǔ)七年制，主攻生物信息學方向，擅長大樣本多組學數(shù)據(jù)分析和R語言開發(fā)。主導(dǎo)生信算法模塊的研發(fā)與落地，完成搭建多個新型修飾類算法模塊與分析流程，涉及分析內(nèi)容包含機器學習識別臨床生物標志物、蛋白基因組整合分子分型分析、新型修飾數(shù)據(jù)挖掘、調(diào)控酶關(guān)聯(lián)分析等方向。具有豐富的臨床多組學大隊列項目分析經(jīng)驗與修飾組學研發(fā)經(jīng)歷，申報修飾類分析專利多項。
 
金鑫 高級工程師
碩士畢業(yè)于東北林業(yè)大學細胞生物學專業(yè)，從事植物蛋白質(zhì)組學方向研究，主要內(nèi)容為植物逆境脅迫的蛋白質(zhì)組學與生理學分析，揭示植物抗逆的分子機制。主要從事樣品制備相關(guān)工作，負責樣品制備流程的搭建，制備方法的開發(fā)與優(yōu)化，樣品制備自動化體系的建立等內(nèi)容。對各類樣本的制備路線及技術(shù)流程具有非常豐富的經(jīng)驗，曾對多種不同類型樣本進行方法開發(fā)和流程優(yōu)化等工作。

參考附件：報名回執(zhí)表