QIAGEN土壤微生物提取試劑明星家族又添新成員

當(dāng)微生物的存在首次在18世紀(jì)的顯微鏡下被發(fā)現(xiàn)時，很少有人可以想象他們在地球上無所不在�，F(xiàn)如今，甚至可以毫不夸張的說，微生物在操縱整個世界。它們隨處可見，包括在最惡劣，最荒涼的環(huán)境中，它們參與物理環(huán)境和有機生物圈的調(diào)節(jié)。微生物對人類健康和疾病的重要性在最近幾十年也變得十分明顯。

宏基因組學(xué)是當(dāng)下廣為認(rèn)可的微生物組研究手段，對于宏基因組研究過程中建庫及質(zhì)控的關(guān)鍵一般大家都了然于心，而往往忽略了好的開始是成功的一半。那么在整個研究過程中樣本制備環(huán)節(jié)有哪些關(guān)鍵成功要素？

有效的裂解對核酸產(chǎn)量和微生物多樣性表現(xiàn)至關(guān)重要。經(jīng)研究^[1]發(fā)現(xiàn)，珠磨研磨裂解法可實現(xiàn)對不同特性樣本的無差異化裂解，更適合于微生物組樣本中核酸的徹底釋放。PowerSoil Pro系列試劑盒，采用的PowerBead Pro tube裂解管包含合適粒徑的氧化鋯研磨珠，無懼難裂微生物，有效實現(xiàn)等效裂解。

困擾土壤樣本DNA提取的另一大問題是其高含量的腐殖酸。腐殖酸與核酸一樣都是大分子親水性陰離子聚合物，很容易在最后步驟和核酸一起被抽提出來。PowerSoil Pro系列試劑盒采用升級抑制劑去除專利技術(shù)IRT (Inhibitor Removal Technology)，無需在純化過程中反復(fù)洗滌，室溫操作混合后離心1分鐘即可徹底去除所有PCR抑制劑。

熟悉QIAGEN的同學(xué)都知道上面提到的PowerSoil Pro系列試劑盒是Q家專為微生物組學(xué)研究開發(fā)的核酸提取明星產(chǎn)品。單個樣本提取只需短短20分鐘，獲得的核酸相比其他提取方法在下游NGS結(jié)果中可獲得更高的alpha diversity。美中不足的是，對于一次需要處理幾十甚至上百樣本時較為費時費力。

DNeasy 96 PowerSoil Pro Kit的適時出現(xiàn)恰好解決了這個問題。DNeasy 96 PowerSoil Pro Kit含96孔板式硅膠模離心柱，配合離心機或QIAvac96真空底座可以一次手工純化高達(dá)96個堆肥，粘土，表層土壤及糞便和腸道樣本。

作為PowerSoil Pro家族新成員，DNeasy 96 PowerSoil Pro Kit秉承了Pro家族一貫優(yōu)點：PowerBead Pro Plate 裂解板一次可同時完成96個土壤或糞便樣本的高效裂解，高通量的同時確保實現(xiàn)等效裂解，相比其他裂解方法可獲得更高產(chǎn)量。
 

配備升級抑制劑去除專利技術(shù)IRT試劑，無需更換純化柱也無需反復(fù)洗滌，加入專利試劑后混合離心1分鐘徹底去除96個樣本中的抑制劑。實驗表明，該試劑盒純化表現(xiàn)與DNeasy PowerSoil Pro Kit一致。

得益于對樣本中所有微生物包括真菌的等效裂解以及PCR抑制劑徹底去除，經(jīng)DNeasy 96 PowerSoil Pro Kit純化所得NGS下游實驗結(jié)果可獲得更高的alpha diversity且符合真實微生物比例。

為慶祝PowerSoil Pro家族新成員的加入，即日起至10月30日，點擊申請試用填寫試用申請即有機會免費體驗PowerSoil Pro系列試劑盒給您的微生物組學(xué)研究實驗帶來的革命性變化。

參考文獻(xiàn)：

[1] Paul I Costea, Georg Zeller, et.al. Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies. Nature Biotechnology volume 35 number 11 Nov. 2017