Porvair:多向性表觀遺傳靶點篩選的高通量ChIP測定

Porvair Sciences 發(fā)表了一份應(yīng)用案例說明，闡述了 ChromaTrap 的新型 96 孔染色質(zhì)免疫沉淀反應(yīng) (ChIP) 測定技術(shù)。

現(xiàn)代表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域科技發(fā)展迅速，所有指導(dǎo)原則都是通過活體內(nèi)蛋白質(zhì)與 DNA 的動態(tài)綁定來調(diào)節(jié)基因，研究人員闡述道。其關(guān)鍵在于需要分析大量的高含量和低含量調(diào)節(jié)機制，來系統(tǒng)性地描繪出接觸病原體后蛋白質(zhì)與 DNA 的交互反應(yīng)。

染色質(zhì)免疫沉淀反應(yīng) (ChIP) 測定通常用于研究這兩者之間的關(guān)聯(lián)，一直以來均局限于大量的樣品研究，費力的清洗步驟導(dǎo)致大量樣品丟失，噪聲比較低，而且再現(xiàn)性差。

新型應(yīng)用案例說明中詳細闡述了 Chromatrap®96 Pro-A（一種 96 孔微孔板）的使用，所有孔都含有固相的固態(tài)多孔聚合物 BioVyonTM（其中通過化學(xué)反應(yīng)綁定蛋白質(zhì) A），因此 96 ChIP 測定法可在同一個孔板上同時運行。

為確定在篩選表觀遺傳靶點時 Chromatrap®96 是否易于使用、是否具有高度的設(shè)計靈活性以及高度的再現(xiàn)性，我們必須在 96 孔板上對三個人體染色質(zhì)樣品（HepG2、HeLa 和 K562）的三個基因靶點（GAPDH、beta-globin 和 PABPC1）同時開展常規(guī)表觀遺傳標記（H3、H4、H3K4me3 和 RNA pol II）的綁定效率和占用率研究，并使用 qPCR 進行分析。應(yīng)用案例說明中詳述了分析法、數(shù)據(jù)解讀以及統(tǒng)計分析法，以及使用新型 Chromatrap®96 高通量 ChIP 測定板的好處。該測定板具備多向性靶點篩選功能、靈活的實驗設(shè)計、可靠的再現(xiàn)性、高數(shù)據(jù)指令以及全自動移液功能。

如欲下載該應(yīng)用案例說明副本，請訪問 www.chromatrap.com/uploads/documents/TL0011__High_Throughput_App_Note_1.pdf。如要了解詳情或與技術(shù)產(chǎn)品專家討論您的應(yīng)用案例，請致電 +44-1372-824290 或電郵至 amy.beynon@chromatrap.com 聯(lián)系 Porvair Sciences 公司。