羅氏NimbleGen最新推出CGH ISCA Plus細胞遺傳學(xué)芯片
瀏覽次數(shù):3562 發(fā)布日期:2012-3-12
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羅氏 NimbleGen 最新推出 CGH ISCA Plus 細胞遺傳學(xué)芯片
羅氏NimbleGen最新推出針對細胞遺傳學(xué)的NimbleGen CGH ISCA Plus細胞遺傳學(xué)芯片。細胞遺傳學(xué)研究在發(fā)育異常及腫瘤研究中都占有重要地位,其主要研究內(nèi)容為染色體異,F(xiàn)象,包括拷貝數(shù)改變(Copy Number Variation, CNV)以及雜合性丟失(Loss of Heterozygosity, LOH)。這款新產(chǎn)品擁有420萬個DNA探針,包含有檢測CNV的CGH探針以及檢測LOH的SNP探針,可同時亦高分辨率地檢測CNV及LOH。不需要任何實驗流程的改變,就可以完成同時兩種測試。
該款芯片包含了來自ISCA,OMIM,Decipher等多個遺傳性疾病數(shù)據(jù)庫,廣泛的細胞遺傳學(xué)研究內(nèi)容。
針對418種的疾病相關(guān)區(qū)域進行設(shè)計,包括ISCA,OMIM,Decipher數(shù)據(jù)庫的4200種基因:
● 含有約50萬個CGH探針,CNV分辨率可達15-20 Kb
● 通過64000個SNP探針檢測LOH,分辨率達到5 Mb
● 一張芯片可檢測多個樣本,降低實驗成本
在數(shù)據(jù)分析方面, 該產(chǎn)品配有不同的設(shè)計文件,可以以不同CNV及LOH分辨率解讀芯片實驗結(jié)果,并參照ISCA數(shù)據(jù)庫進行分析,如ISCA 44k, ISCA 60K,ISCA 105K,ISCA 180K,可以根據(jù)研究需要進行選擇。芯片可使用Deva、Nexus Copy Number™ Analysis 軟件進行分析,按照不同設(shè)計文件進行數(shù)據(jù)儲存及處理,獲得圖形化的CNV、LOH分析結(jié)果,并可與 Decipher 、ISCA 等數(shù)據(jù)庫相連,生成細胞遺傳學(xué)報告。
該芯片實驗的優(yōu)勢在于快速、高分辨率地檢測全基因組水平的染色體異常情況。相比傳統(tǒng)的染色體分型、原位雜交方法,更加高效,同時還可為每個樣本選取合適的對照,如腫瘤組織樣本與正常組織樣本進行對比,出生缺陷兒童的樣本與其正常父母樣本進行直接比較。
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http://www.nimblegen.com/products/cgh/isca/index.html